在反應瓶中加入丙二酸二乙酯、硫脲和溶劑，加熱至回流，滴加縛酸劑，反應數小時，冷卻，過濾得4，6-二羥基-2-巰基嘧啶。然后，將該巰基嘧啶溶于縛酸劑中，加硫酸二甲酯，攪拌反應數小時后，反應液加熱至沸騰，然后加活性炭脫色過濾，濾液冷卻后用硫酸酸化生成白色結晶為成品。

用丙二酸二乙酯與S-甲基異硫脲鹽反應，也能得到2-甲硫基-4，6-二羥基嘧啶。